Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC27P30260 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC27P30260 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC27P30260 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC27P30260 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms