Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMOD1P29536 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMOD1P29536 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms