Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHC1P29353 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHC1P29353 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHC1P29353 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHC1P29353 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHC1P29353 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms