Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms