Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB5P28074 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB5P28074 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms