Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMLP26374 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMLP26374 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMLP26374 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMLP26374 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms