Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNMT1P26358 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms