Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRKCHP24723 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKCHP24723 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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