Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPREP23469 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPREP23469 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPREP23469 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPREP23469 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPREP23469 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms