Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMY2BP19961 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms