Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF3P18847 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATF3P18847 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF3P18847 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF3P18847 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF3P18847 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms