Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPI1P17947 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPI1P17947 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPI1P17947 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPI1P17947 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPI1P17947 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPI1P17947 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms