Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMPD1P17405 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPD1P17405 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms