Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA2P17301 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms