Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD44P16070 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD44P16070 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD44P16070 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD44P16070 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD44P16070 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms