Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAV1P15498 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAV1P15498 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAV1P15498 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAV1P15498 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAV1P15498 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAV1P15498 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAV1P15498 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAV1P15498 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VAV1P15498 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms