Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FCER1AP12319 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FCER1AP12319 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms