Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RALAP11233 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RALAP11233 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RALAP11233 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RALAP11233 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RALAP11233 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms