Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD28P10747 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD28P10747 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD28P10747 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD28P10747 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD28P10747 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms