Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRFP10586 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRFP10586 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms