Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC192P0DO97 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC192P0DO97 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms