Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAPPC2BP0DI82 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms