Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SRPRAP08240 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms