Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA1P05813 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms