Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYBBP04839 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYBBP04839 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYBBP04839 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYBBP04839 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYBBP04839 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms