Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV3-7P01780 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV3-7P01780 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms