Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms