Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGKV1-17P01599 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-17P01599 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms