Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD3O95983 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD3O95983 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD3O95983 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms