Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYF2O95926 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYF2O95926 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYF2O95926 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYF2O95926 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYF2O95926 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYF2O95926 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYF2O95926 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SYF2O95926 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYF2O95926 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms