Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BBOX1O75936 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBOX1O75936 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms