Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms