Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN15O75808 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN15O75808 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms