Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP6O75581 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP6O75581 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRP6O75581 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRP6O75581 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRP6O75581 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRP6O75581 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP6O75581 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP6O75581 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRP6O75581 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRP6O75581 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRP6O75581 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRP6O75581 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP6O75581 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP6O75581 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP6O75581 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP6O75581 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRP6O75581 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRP6O75581 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRP6O75581 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms