Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITX3O75364 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITX3O75364 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PITX3O75364 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms