Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAK2O60296 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms