Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCO2O43819 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCO2O43819 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCO2O43819 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCO2O43819 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCO2O43819 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms