Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms