Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms