Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTIFO43310 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTIFO43310 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTIFO43310 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTIFO43310 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTIFO43310 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTIFO43310 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTIFO43310 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTIFO43310 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTIFO43310 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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