Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms