Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms