Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLIM4O00461 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLIM4O00461 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms