Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CDO00329 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms