Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP1O00294 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP1O00294 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP1O00294 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP1O00294 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP1O00294 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP1O00294 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP1O00294 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms