Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HIP1O00291 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIP1O00291 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIP1O00291 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIP1O00291 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIP1O00291 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HIP1O00291 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIP1O00291 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIP1O00291 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms