Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFKBIEO00221 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIEO00221 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms