Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAPO00193 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAPO00193 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAPO00193 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMAPO00193 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAPO00193 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAPO00193 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAPO00193 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAPO00193 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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