Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX39AO00148 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX39AO00148 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms