Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRRM5B3KS81 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms